Le Centre de compétences Nature travaille avec un mandat de prestations du Secrétariat général DDPS d'armasuisse Immobilier.
En tant qu'unité de biodiversité du DDPS, le CCOM Natur est responsable de l'application de la loi sur la protection de la nature et du patrimoine culturel au sein du département. Il conseille sur les questions techniques, donne des directives et assure le contrôle dans le domaine de la protection de la nature et du patrimoine.
Une étroite collaboration avec les services civils spécialisés de la Confédération, des cantons, des communes et des organisations non gouvernementales (ONG) facilite la sauvegarde des intérêts du DDPS.
Depuis 1999, l'instrument principal est le concept de la Nature, Paysage et Armées (NLA) dans le cadre du programme départemental, qui a permis de cartographier les valeurs naturelles de 180 sites de l'armée, également en dehors des zones protégées, et de faire correspondre l'utilisation militaire et agricole ainsi que «l'utilisation de loisirs» à leur besoin de protection.

Depuis 1999, le Département fédéral de la défense, de la protection de la population et des sports (DDPS) a cartographié les habitats dignes de protection sur 180 sites de l'armée dans le cadre du programme paysage, nature, armée. Sur chaque site, les utilisations militaires, agricoles et récréatives des places de tir, des places d'armes et des aérodromes militaires ainsi que les valeurs naturelles sont coordonnées dans un concept. Le dossier réglemente également le maintien des habitats dignes de protection et le suivi de leur réussite.

• …signifie la diversité de la vie biologique : concrètement, la diversité des gènes, des espèces animales et végétales et de leurs habitats, interconnectés dans les paysages.
• …augmente la stabilité et l'efficacité des cycles écologiques, qui à leur tour constituent la base de notre économie et de notre société.
• …est à l'ordre du jour politique mondial depuis la conférence des Nations unies sur l'environnement de 1992 à Rio de Janeiro. Depuis lors, le changement climatique a encore accéléré l'extinction mondiale des espèces.
• ...est surveillé dans toute la Suisse depuis 2000 et, depuis 2012, également dans 26 place d'armes, place de tir et aérodromes.
  

Il y a le même nombre d'espèces d'oiseaux nicheurs sur les zones militaires (38-40/km2) que sur les sites civils. Cependant, des espèces animales et végétales rares figurant sur la "liste rouge" sont trouvées avec une fréquence supérieure à la moyenne sur des sites militaires. La proportion de prairies et de pâturages dignes de protection est plus de trois fois plus élevée sur les sites militaires que dans le reste de la Suisse. Les 11 types d'habitats les plus précieux sur les 15 dignes de protection se trouvent plus fréquemment sur les sites du DDPS qu'en dehors. En outre, les sites militaires sont plus souvent que la moyenne situés dans des inventaires de paysages d'importance nationale.