Das Kompetenzzentrum (KOMZ) Natur VBS arbeitet mit einem Leistungsauftrag des Generalsekretariats VBS bei armasuisse Immobilien.

Als Biodiversitätsfachstelle des VBS ist das KOMZ Natur für den Vollzug des Natur- und Heimatschutzgesetzes innerhalb des Departements zuständig. Es berät bei fachlichen Fragen, erlässt Vorgaben und stellt das Controlling im Bereich Natur- und Heimatschutz sicher. 

Die enge Zusammenarbeit mit den zivilen Fachstellen von Bund, Kantonen, Gemeinden und Nichtregierungsorganisationen (NGOs) erleichtert die Wahrung der VBS-Interessen.

Hauptinstrument sind seit 1999 die Konzepte Natur, Landschaft und Armee (NLA) im Rahmen des departementalen Programms, welche auf 180 Armeearealen die Naturwerte auch ausserhalb der Schutzgebiete kartiert und die militärische und landwirtschaftliche Nutzung sowie die «Freizeitnutzung» auf ihre Schutzbedürftigkeit abgestimmt haben.

Seit 1999 hat das Eidgenössische Departement für Verteidigung, Bevölkerungsschutz und Sport (VBS) im Zuge des Programms Natur-Landschaft-Armee auf 180 Armeearealen die schützenswerten Lebensräume kartiert. Auf jedem Areal werden die Militär-, Landwirtschafts- und Freizeit-Nutzungen der Waffen-, Schiess- und Militärflugplätze und die Naturwerte in einem Konzept aufeinander abgestimmt. Das Dossier regelt auch den Unterhalt der schützenswerten Lebensräume und die Erfolgskontrolle.

• ... meint die Vielfalt biologischen Lebens: konkret also die Vielfalt der Gene, der Tier- und Pflanzenarten und ihrer zu Landschaften vernetzten Lebensräume.
• ... erhöht die Stabilität und Leistungsfähigkeit der ökologischen Kreisläufe, die wiederum die Grundlage unserer Wirtschaft und Gesellschaft bilden.
• ... steht seit der UNO-Umweltkonferenz 1992 in Rio de Janeiro auf der global-politischen Agenda. Seither hat der Klimawandel das weltweite Artensterben weiter beschleunigt.
• ... wird seit dem Jahr 2000 schweizweit und seit 2012 zusätzlich auch auf 26 Waffen-, Schiess- und Flugplätzen in einem Monitoring überwacht.

Auf Armeearealen gibt es gleich viele Brutvogelarten (38-40/km²) wie auf Zivilarealen. Seltene Tier- und Pflanzenarten der sogenannten «Roten Liste»  sind auf Armeearealen allerdings überdurchschnittlich häufig anzutreffen. Der Anteil an schützenswerter Wiesen und Weiden ist auf Armeearealen über dreimal höher als in der übrigen Schweiz. Die wertvollsten 11 von 15 schützenswerten Lebensraumtypen sind auf VBS-Arealen häufiger anzutreffen als ausserhalb. Zudem liegen die Armeeareale überdurchschnittlich häufig in Landschaftsinventaren von nationaler Bedeutung.